为规范、指导、推进实验室的建设和管理工作，把实验室建设成为在基础、应用以及学术交流等方面代表国家水平的科研基地，实验室实行学术委员会指导下的主任负责制。学术委员会是实验室的学术指导机构，在实验室的建设中起关键的指导、监督与评审作用，实验室高度重视并充分发挥学术委员会的作用。
实验室学术委员会主要职责包括：对实验室发展战略规划、重大科研部署提出咨询意见与建议；审定开放课题基金指南和审批开放课题基金申请；听取和审议实验室主任年度工作报告，评议实验室年度工作；审查和建议与实验室有关的主要学术活动；协调实验室对外联系与学术交流工作。
学术委员会主任
陈 霖 院士 中国科学院生物物理研究所
学术委员会副主任
石光明 教授 西安电子科技大学
孙长银 教授 安徽大学
学术委员会委员
潘 纲 教授 浙江大学
汪 萌 教授 合肥工业大学
缪向水 教授 华中科技大学
熊红凯 教授 上海交通大学
黄庆明 教授 中国科学院大学
尹宝才 教授 北京工业大学
吴 枫 教授 中国科学技术大学
谢庆国 教授 中国科学技术大学
张勇东 教授 中国科学技术大学
李厚强 教授 中国科学技术大学
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